さくらサーバーにて、WordPressをトップディレクトリに移動（引っ越し）した際に、500エラーがすべてのページで出た。
原因は、「WP No Category Base」プラグインでした。
WP No Category Baseプラグインを削除し、トップディレクトリの.htaccessをアップし直すとなおった。

参考までに。